Mus musculus Gene: Ndst1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-150104.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Ndst1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | N-deacetylase/N-sulfotransferase (heparan glucosaminyl) 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 1200015G06Rik; b2b2230Clo; Hsst; NDST-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000054008 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
N-deacetylase/N-sulfotransferase (heparan glucosaminyl) 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000070614:
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 18:60685978-60713389 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | D3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Glycosaminoglycan metabolism pathway
Disease pathway
MPS IV - Morquio syndrome B pathway
MPS IV - Morquio syndrome A pathway
MPS IIIC - Sanfilippo syndrome C pathway
Metabolism pathway
MPS I - Hurler syndrome pathway
MPS IIID - Sanfilippo syndrome D pathway
Defective B4GALT7 causes EDS, progeroid type pathway
Diseases of glycosylation pathway
Defective CHSY1 causes TPBS pathway
Defective B3GAT3 causes JDSSDHD pathway
MPS II - Hunter syndrome pathway
Diseases associated with glycosaminoglycan metabolism pathway
HS-GAG biosynthesis pathway
Heparan sulfate/heparin (HS-GAG) metabolism pathway
MPS IX - Natowicz syndrome pathway
Glycogen storage diseases pathway
MPS VII - Sly syndrome pathway
Defective CHST14 causes EDS, musculocontractural type pathway
Defective CHST3 causes SEDCJD pathway
MPS VI - Maroteaux-Lamy syndrome pathway
Defective B4GALT1 causes B4GALT1-CDG (CDG-2d) pathway
MPS IIIB - Sanfilippo syndrome B pathway
MPS IIIA - Sanfilippo syndrome A pathway
Defective PAPSS2 causes SEMD-PA pathway
Defective EXT1 causes exostoses 1, TRPS2 and CHDS pathway
Mucopolysaccharidoses pathway
Defective CHST6 causes MCDC1 pathway
Myoclonic epilepsy of Lafora pathway
Metabolism of carbohydrates pathway
Defective EXT2 causes exostoses 2 pathway
Defective SLC26A2 causes chondrodysplasias pathway
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KEGG |
Glycosaminoglycan biosynthesis pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
HS-GAG biosynthesis pathway
Mucopolysaccharidoses pathway
Myoclonic epilepsy of Lafora pathway
Defective B4GALT7 causes EDS, progeroid type pathway
Defective CHST6 causes MCDC1 pathway
MPS VI - Maroteaux-Lamy syndrome pathway
Defective PAPSS2 causes SEMD-PA pathway
Metabolism of carbohydrates pathway
MPS IIID - Sanfilippo syndrome D pathway
Defective SLC26A2 causes chondrodysplasias pathway
MPS IX - Natowicz syndrome pathway
Defective EXT1 causes exostoses 1, TRPS2 and CHDS pathway
Defective CHST14 causes EDS, musculocontractural type pathway
Heparan sulfate/heparin (HS-GAG) metabolism pathway
MPS IV - Morquio syndrome B pathway
Defective B3GAT3 causes JDSSDHD pathway
Defective CHST3 causes SEDCJD pathway
MPS IV - Morquio syndrome A pathway
Defective EXT2 causes exostoses 2 pathway
Diseases associated with glycosaminoglycan metabolism pathway
MPS II - Hunter syndrome pathway
Defective B4GALT1 causes B4GALT1-CDG (CDG-2d) pathway
Glycosaminoglycan metabolism pathway
Diseases of glycosylation pathway
MPS VII - Sly syndrome pathway
Defective CHSY1 causes TPBS pathway
Metabolism pathway
MPS I - Hurler syndrome pathway
MPS IIIA - Sanfilippo syndrome A pathway
MPS IIIC - Sanfilippo syndrome C pathway
Disease pathway
Glycogen storage diseases pathway
MPS IIIB - Sanfilippo syndrome B pathway
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KEGG |
Glycosaminoglycan biosynthesis pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.486185 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_008306 XM_006525667 XM_006525668 XM_006525669 XM_006525670 XM_006525671 XM_006525672 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS37834 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||