Mus musculus Gene: Dmd | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-158412.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Dmd | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | dystrophin, muscular dystrophy | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Dp427; Dp71; DXSmh7; DXSmh9; dys; mdx; pke | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000045103 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
dystrophin, muscular dystrophy
dystrophin, muscular dystrophy
dystrophin, muscular dystrophy
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000198947:
The dystrophin gene is the largest gene found in nature, measuring 2.4 Mb. The gene was identified through a positional cloning approach, targeted at the isolation of the gene responsible for Duchenne (DMD) and Becker (BMD) Muscular Dystrophies. DMD is a recessive, fatal, X-linked disorder occurring at a frequency of about 1 in 3,500 new-born males. BMD is a milder allelic form. In general, DMD patients carry mutations which cause premature translation termination (nonsense or frame shift mutations), while in BMD patients dystrophin is reduced either in molecular weight (derived from in-frame deletions) or in expression level. The dystrophin gene is highly complex, containing at least eight independent, tissue-specific promoters and two polyA-addition sites. Furthermore, dystrophin RNA is differentially spliced, producing a range of different transcripts, encoding a large set of protein isoforms. Dystrophin (as encoded by the Dp427 transcripts) is a large, rod-like cytoskeletal protein which is found at the inner surface of muscle fibers. Dystrophin is part of the dystrophin-glycoprotein complex (DGC), which bridges the inner cytoskeleton (F-actin) and the extra-cellular matrix. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome X:82948870-85206141 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | C1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 35 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 26 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
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Gene ID
Gene Order
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Striated Muscle Contraction pathway
Extracellular matrix organization pathway
Muscle contraction pathway
Non-integrin membrane-ECM interactions pathway
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KEGG |
Arrhythmogenic right ventricular cardiomyopathy (ARVC) pathway
Hypertrophic cardiomyopathy (HCM) pathway
Dilated cardiomyopathy pathway
Viral myocarditis pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Striated Muscle Contraction pathway
Extracellular matrix organization pathway
Non-integrin membrane-ECM interactions pathway
Muscle contraction pathway
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KEGG |
Arrhythmogenic right ventricular cardiomyopathy (ARVC) pathway
Hypertrophic cardiomyopathy (HCM) pathway
Dilated cardiomyopathy pathway
Viral myocarditis pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.275608 Mm.368403 Mm.407754 Mm.416750 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_007868 XM_006527766 XM_006527773 XM_006527776 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS41047 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||