Homo sapiens Gene: DMD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-54131.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | DMD | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | dystrophin | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | BMD; CMD3B; DXS142; DXS164; DXS206; DXS230; DXS239; DXS268; DXS269; DXS270; DXS272; MRX85 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000198947 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
dystrophin
dystrophin
dystrophin
dystrophin
dystrophin
dystrophin
dystrophin
dystrophin
dystrophin
dystrophin
dystrophin
dystrophin
dystrophin
dystrophin
dystrophin
dystrophin
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dystrophin
dystrophin
dystrophin
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The dystrophin gene is the largest gene found in nature, measuring 2.4 Mb. The gene was identified through a positional cloning approach, targeted at the isolation of the gene responsible for Duchenne (DMD) and Becker (BMD) Muscular Dystrophies. DMD is a recessive, fatal, X-linked disorder occurring at a frequency of about 1 in 3,500 new-born males. BMD is a milder allelic form. In general, DMD patients carry mutations which cause premature translation termination (nonsense or frame shift mutations), while in BMD patients dystrophin is reduced either in molecular weight (derived from in-frame deletions) or in expression level. The dystrophin gene is highly complex, containing at least eight independent, tissue-specific promoters and two polyA-addition sites. Furthermore, dystrophin RNA is differentially spliced, producing a range of different transcripts, encoding a large set of protein isoforms. Dystrophin (as encoded by the Dp427 transcripts) is a large, rod-like cytoskeletal protein which is found at the inner surface of muscle fibers. Dystrophin is part of the dystrophin-glycoprotein complex (DGC), which bridges the inner cytoskeleton (F-actin) and the extra-cellular matrix. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome X:31097677-33339441 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | p21.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 34 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 21 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Striated Muscle Contraction pathway
Extracellular matrix organization pathway
Non-integrin membrane-ECM interactions pathway
Muscle contraction pathway
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KEGG |
Arrhythmogenic right ventricular cardiomyopathy (ARVC) pathway
Hypertrophic cardiomyopathy (HCM) pathway
Dilated cardiomyopathy pathway
Viral myocarditis pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.495912 Hs.653669 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_000109 NM_004006 NM_004009 NM_004010 NM_004011 NM_004012 NM_004013 NM_004014 NM_004015 NM_004016 NM_004017 NM_004018 NM_004020 NM_004021 NM_004022 NM_004023 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS14231 CCDS14232 CCDS14233 CCDS14234 CCDS48091 CCDS55394 CCDS55395 CCDS75965 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 02303 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||