Homo sapiens Gene: IFITM3 | |||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-16268.6 | ||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | IFITM3 | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | interferon induced transmembrane protein 3 | ||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 1-8U; DSPA2b; IP15 | ||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000142089 | ||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
interferon induced transmembrane protein 3
interferon induced transmembrane protein 3
interferon induced transmembrane protein 3
interferon induced transmembrane protein 3
|
||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||
Summary |
IFITM3 is an antiviral restriction factor that mediates cellular resistance to influenza A H1N1 virus, West Nile virus, and Dengue virus.
IFITM3 is post-translationally regulated by S-palmitoylation on membrane-proximal cysteines, which controls its clustering in membrane compartments and its antiviral activity against influenza virus.
NRAV, a long noncoding RNA, modulates antiviral responses by negatively regulating the initial transcription of multiple critical interferon-stimulated genes, including IFITM3 and MX1, by affecting their histone modification.
|
||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is an interferon-induced membrane protein that helps confer immunity to influenza A H1N1 virus, West Nile virus, and dengue virus. Two transcript variants, only one of them protein-coding, have been found for this gene. Another variant encoding an N-terminally truncated isoform has been reported, but the full-length nature of this variant has not been determined. [provided by RefSeq, May 2012] |
||||||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 11:319669-327537 | ||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||
Band | p15.5 | ||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 12 experimentally validated interaction(s) in this database.
|
||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||
No orthologs found for this gene | |||||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Interferon alpha/beta signaling pathway
Cytokine Signaling in Immune system pathway
Interferon Signaling pathway
Immune System pathway
|
||||||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 10410 | ||||||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_021034 | ||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:5414 | ||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 605579 | ||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS41585 | ||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 10410 | ||||||||||||||||||||||||||