Mus musculus Gene: Tnfrsf13c | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-166389.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Tnfrsf13c | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | tumor necrosis factor receptor superfamily, member 13c | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2010006P15Rik; BAFF-R; Baffr; Bcmd; Bcmd-1; Bcmd1; Lvis22 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000068105 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
tumor necrosis factor receptor superfamily, member 13c
tumor necrosis factor receptor superfamily, member 13c
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||
Summary |
Tnfrsf13c (BAFFR) expression is critical for innate immune activation and antiviral immunity. Tnfrsf13c deficiency results in reduced enforced viral replication, limited type I interferon production, and reduced adaptive immunity.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000159958:
B cell-activating factor (BAFF) enhances B-cell survival in vitro and is a regulator of the peripheral B-cell population. Overexpression of Baff in mice results in mature B-cell hyperplasia and symptoms of systemic lupus erythematosus (SLE). Also, some SLE patients have increased levels of BAFF in serum. Therefore, it has been proposed that abnormally high levels of BAFF may contribute to the pathogenesis of autoimmune diseases by enhancing the survival of autoreactive B cells. The protein encoded by this gene is a receptor for BAFF and is a type III transmembrane protein containing a single extracellular cysteine-rich domain. It is thought that this receptor is the principal receptor required for BAFF-mediated mature B-cell survival. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 15:82221744-82224339 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | E1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 6 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
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Gene ID
Gene Order
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Cytokine-cytokine receptor interaction pathway
Primary immunodeficiency pathway
Intestinal immune network for IgA production pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Cytokine-cytokine receptor interaction pathway
Primary immunodeficiency pathway
Intestinal immune network for IgA production pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q3U106 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 72049 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.240047 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_028075 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS27684 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1919299 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Tnfrsf13c | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AC104325 AK156387 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | BAE33695 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 72049 | ||||||||||||||||||||||