Mus musculus Gene: Cnot6 | |||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-167338.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Cnot6 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | CCR4-NOT transcription complex, subunit 6 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | CCR4 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000020362 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
CCR4-NOT transcription complex, subunit 6
CCR4-NOT transcription complex, subunit 6
|
||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000113300:
The protein encoded by this gene is a subunit of the CCR4-NOT core transcriptional regulation complex. The encoded protein has a 3'-5' RNase activity and prefers polyadenylated substates. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 11:49671503-49712723 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | B1.2 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 17 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Deadenylation of mRNA pathway
Gene Expression pathway
Deadenylation-dependent mRNA decay pathway
|
||||||||||||||||||||||
KEGG |
RNA degradation pathway
|
||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Deadenylation of mRNA pathway
Deadenylation-dependent mRNA decay pathway
Gene Expression pathway
|
||||||||||||||||||||||
KEGG |
RNA degradation pathway
|
||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.247113 Mm.431753 Mm.475441 Mm.487524 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001290741 NM_212484 XM_006531940 XM_006531941 XM_006531942 XM_006531943 XM_006531944 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS24621 CCDS70172 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||