Mus musculus Gene: Chrna3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-167498.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Chrna3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | (a)3; A730007P14Rik; Acra-3; Acra3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000032303 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 3
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000080644:
This locus encodes a member of the nicotinic acetylcholine receptor family of proteins. Members of this family of proteins form pentameric complexes comprised of both alpha and beta subunits. This locus encodes an alpha-type subunit, as it contains characteristic adjacent cysteine residues. The encoded protein is a ligand-gated ion channel that likely plays a role in neurotransmission. Polymorphisms in this gene have been associated with an increased risk of smoking initiation and an increased susceptibility to lung cancer. Alternatively spliced transcript variants have been described. [provided by RefSeq, Nov 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 9:55011343-55026559 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Neurotransmitter Receptor Binding And Downstream Transmission In The Postsynaptic Cell pathway
Presynaptic nicotinic acetylcholine receptors pathway
Highly sodium permeable acetylcholine nicotinic receptors pathway
Neuronal System pathway
Activation of Nicotinic Acetylcholine Receptors pathway
Highly calcium permeable postsynaptic nicotinic acetylcholine receptors pathway
Acetylcholine Binding And Downstream Events pathway
Postsynaptic nicotinic acetylcholine receptors pathway
Highly calcium permeable nicotinic acetylcholine receptors pathway
Transmission across Chemical Synapses pathway
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KEGG |
Neuroactive ligand-receptor interaction pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Neuronal System pathway
Highly calcium permeable nicotinic acetylcholine receptors pathway
Postsynaptic nicotinic acetylcholine receptors pathway
Highly sodium permeable acetylcholine nicotinic receptors pathway
Activation of Nicotinic Acetylcholine Receptors pathway
Presynaptic nicotinic acetylcholine receptors pathway
Transmission across Chemical Synapses pathway
Highly calcium permeable postsynaptic nicotinic acetylcholine receptors pathway
Neurotransmitter Receptor Binding And Downstream Transmission In The Postsynaptic Cell pathway
Acetylcholine Binding And Downstream Events pathway
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KEGG |
Neuroactive ligand-receptor interaction pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q8R4G9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q0VBK4 Q8VI11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 110834 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_145129 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS23199 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:87887 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Chrna3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC156832 AC161264 AF325346 AF472588 AK051730 AK053497 AK080415 AY574262 BC120597 BC120599 CH466522 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAI20598 AAI20600 AAL37362 AAL84757 AAS90358 BAC34740 BAC35404 BAC37909 EDL25838 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 110834 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||