Homo sapiens Gene: CHRNA3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-24910.7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | CHRNA3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | cholinergic receptor, nicotinic, alpha 3 (neuronal) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | LNCR2; NACHRA3; PAOD2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000080644 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
cholinergic receptor, nicotinic, alpha 3
cholinergic receptor, nicotinic, alpha 3
cholinergic receptor, nicotinic, alpha 3
cholinergic receptor, nicotinic, alpha 3
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This locus encodes a member of the nicotinic acetylcholine receptor family of proteins. Members of this family of proteins form pentameric complexes comprised of both alpha and beta subunits. This locus encodes an alpha-type subunit, as it contains characteristic adjacent cysteine residues. The encoded protein is a ligand-gated ion channel that likely plays a role in neurotransmission. Polymorphisms in this gene have been associated with an increased risk of smoking initiation and an increased susceptibility to lung cancer. Alternatively spliced transcript variants have been described. [provided by RefSeq, Nov 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 15:78593052-78621295 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q25.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Neuronal System pathway
Highly calcium permeable nicotinic acetylcholine receptors pathway
Postsynaptic nicotinic acetylcholine receptors pathway
Highly sodium permeable acetylcholine nicotinic receptors pathway
Activation of Nicotinic Acetylcholine Receptors pathway
Presynaptic nicotinic acetylcholine receptors pathway
Transmission across Chemical Synapses pathway
Highly calcium permeable postsynaptic nicotinic acetylcholine receptors pathway
Neurotransmitter Receptor Binding And Downstream Transmission In The Postsynaptic Cell pathway
Acetylcholine Binding And Downstream Events pathway
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KEGG |
Neuroactive ligand-receptor interaction pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.89605 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_000743 NM_001166694 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS10305 CCDS53964 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 07511 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||