Mus musculus Gene: Snx27 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-170458.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Snx27 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | sorting nexin family member 27 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 5730552M22Rik; ESTM45; ESTM47; R75405 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000028136 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
sorting nexin family member 27
sorting nexin family member 27
sorting nexin family member 27
sorting nexin family member 27
sorting nexin family member 27
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] SNX27 co-localizes with CYTIP at the early endosomal compartment of lymphocytes suggesting a role for this interaction in endocytic trafficking and/or signalling
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000143376:
This gene encodes a member of the sorting nexin family, a diverse group of cytoplasmic and membrane-associated proteins involved in endocytosis of plasma membrane receptors and protein trafficking through these compartments. All members of this protein family contain a phosphoinositide binding domain (PX domain). A highly similar protein in mouse is responsible for the specific recruitment of an isoform of serotonin 5-hydroxytryptamine 4 receptor into early endosomes, suggesting the analogous role for the human protein. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 3:94497544-94582716 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | F2.1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 10 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.28160 Mm.396743 Mm.397218 Mm.474655 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001082484 NM_029721 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS38537 CCDS38538 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||