Homo sapiens Gene: RNF6 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-17430.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | RNF6 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | ring finger protein (C3H2C3 type) 6 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000127870 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
ring finger protein (C3H2C3 type) 6
ring finger protein (C3H2C3 type) 6
ring finger protein (C3H2C3 type) 6
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene contains a RING-H2 finger motif. Deletions and mutations in this gene were detected in esophageal squamous cell carcinoma (ESCC), suggesting that this protein may be a potential tumor suppressor. Studies of the mouse counterpart suggested a role of this protein in the transcription regulation that controls germinal differentiation. Multiple alternatively spliced transcript variants encoding the same protein are observed. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 13:26132115-26222493 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q12.13 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 7 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH |
AndrogenReceptor pathway
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REACTOME |
Antigen processing: Ubiquitination & Proteasome degradation pathway
Adaptive Immune System pathway
Immune System pathway
Class I MHC mediated antigen processing & presentation pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.136885 Hs.609300 Hs.717954 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_005977 NM_183043 NM_183044 XM_005266485 XM_005266486 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS9316 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 05027 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||