Mus musculus Gene: Pde6d | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-177111.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Pde6d | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | phosphodiesterase 6D, cGMP-specific, rod, delta | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | AI841218; PrBP/delta | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000026239 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
phosphodiesterase 6D, cGMP-specific, rod, delta
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000156973:
This gene encodes the delta subunit of rod-specific photoreceptor phosphodiesterase (PDE), a key enzyme in the phototransduction cascade. A similar protein in cow functions in solubilizing membrane-bound PDE. In addition to its role in the PDE complex, the encoded protein is thought to bind to prenyl groups of proteins to target them to subcellular organelles called cilia. Mutations in this gene are associated with Joubert syndrome-22. Alternative splicing results in multiple splice variants. [provided by RefSeq, Mar 2014] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:86542994-86582629 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | C5 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 20 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Purine metabolism pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Purine metabolism pathway
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INOH |
Purine nucleotides nucleosides metabolism pathway
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PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.469223 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_008801 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS15121 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||