Homo sapiens Gene: PDE6D | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-83150.5 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PDE6D | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | phosphodiesterase 6D, cGMP-specific, rod, delta | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | JBTS22; PDED | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000156973 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
phosphodiesterase 6D, cGMP-specific, rod, delta
phosphodiesterase 6D, cGMP-specific, rod, delta
phosphodiesterase 6D, cGMP-specific, rod, delta
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes the delta subunit of rod-specific photoreceptor phosphodiesterase (PDE), a key enzyme in the phototransduction cascade. A similar protein in cow functions in solubilizing membrane-bound PDE. In addition to its role in the PDE complex, the encoded protein is thought to bind to prenyl groups of proteins to target them to subcellular organelles called cilia. Mutations in this gene are associated with Joubert syndrome-22. Alternative splicing results in multiple splice variants. [provided by RefSeq, Mar 2014] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:231732425-231786272 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q37.1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 37 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Purine metabolism pathway
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INOH |
Purine nucleotides nucleosides metabolism pathway
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PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001291018 NM_002601 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS33398 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 04056 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||