Mus musculus Gene: Itga4 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-183203.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Itga4 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | integrin alpha 4 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | CD49D; Itga4B | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000027009 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
integrin alpha 4
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000115232:
The product of this gene belongs to the integrin alpha chain family of proteins. Integrins are heterodimeric integral membrane proteins composed of an alpha chain and a beta chain. This gene encodes an alpha 4 chain. Unlike other integrin alpha chains, alpha 4 neither contains an I-domain, nor undergoes disulfide-linked cleavage. Alpha 4 chain associates with either beta 1 chain or beta 7 chain. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:79255426-79333123 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | C3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 421 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Cell adhesion molecules (CAMs) pathway
ECM-receptor interaction pathway
Hematopoietic cell lineage pathway
Regulation of actin cytoskeleton pathway
Leukocyte transendothelial migration pathway
Focal adhesion pathway
Arrhythmogenic right ventricular cardiomyopathy (ARVC) pathway
Hypertrophic cardiomyopathy (HCM) pathway
Dilated cardiomyopathy pathway
Intestinal immune network for IgA production pathway
Leishmaniasis pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Immunoregulatory interactions between a Lymphoid and a non-Lymphoid cell pathway
Cell surface interactions at the vascular wall pathway
Integrin cell surface interactions pathway
Extracellular matrix organization pathway
Adaptive Immune System pathway
Immune System pathway
Hemostasis pathway
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KEGG |
Regulation of actin cytoskeleton pathway
Hematopoietic cell lineage pathway
Cell adhesion molecules (CAMs) pathway
ECM-receptor interaction pathway
Leukocyte transendothelial migration pathway
Focal adhesion pathway
Arrhythmogenic right ventricular cardiomyopathy (ARVC) pathway
Hypertrophic cardiomyopathy (HCM) pathway
Dilated cardiomyopathy pathway
Intestinal immune network for IgA production pathway
Leishmaniasis pathway
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INOH |
Integrin signaling pathway pathway
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PID NCI |
Beta1 integrin cell surface interactions
Integrin family cell surface interactions
VEGFR3 signaling in lymphatic endothelium
Alpha4 beta1 integrin signaling events
a4b7 Integrin signaling
Beta5 beta6 beta7 and beta8 integrin cell surface interactions
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.31903 Mm.378227 Mm.410644 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_010576 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS16168 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||