Mus musculus Gene: Snrpf | |||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-186208.6 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Snrpf | ||||||||||||||||||||||||
Gene Name | small nuclear ribonucleoprotein polypeptide F | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2010013O18Rik; sm-F; SMF; snRNP-F | ||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000020018 | ||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
small nuclear ribonucleoprotein polypeptide F
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000139343:
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 10:93583029-93589706 | ||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||
Band | C2 | ||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 9 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 44 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
mRNA Splicing pathway
SLBP independent Processing of Histone Pre-mRNAs pathway
mRNA Splicing - Minor Pathway pathway
Processing of Capped Intronless Pre-mRNA pathway
Metabolism of non-coding RNA pathway
RNA Polymerase II Transcription Termination pathway
Cleavage of Growing Transcript in the Termination Region pathway
snRNP Assembly pathway
Gene Expression pathway
SLBP Dependent Processing of Replication-Dependent Histone Pre-mRNAs pathway
mRNA Splicing - Major Pathway pathway
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA pathway
RNA Polymerase II Transcription pathway
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KEGG |
Spliceosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
snRNP Assembly pathway
SLBP independent Processing of Histone Pre-mRNAs pathway
SLBP Dependent Processing of Replication-Dependent Histone Pre-mRNAs pathway
mRNA Splicing - Major Pathway pathway
mRNA Splicing - Minor Pathway pathway
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA pathway
Cleavage of Growing Transcript in the Termination Region pathway
RNA Polymerase II Transcription Termination pathway
RNA Polymerase II Transcription pathway
Metabolism of non-coding RNA pathway
Processing of Capped Intronless Pre-mRNA pathway
mRNA Splicing pathway
Gene Expression pathway
RNA Polymerase II Transcription pathway
Cleavage of Growing Transcript in the Termination Region pathway
mRNA Splicing - Major Pathway pathway
mRNA Splicing pathway
Processing of Capped Intronless Pre-mRNA pathway
RNA Polymerase II Transcription Termination pathway
Gene Expression pathway
SLBP independent Processing of Histone Pre-mRNAs pathway
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA pathway
Metabolism of non-coding RNA pathway
SLBP Dependent Processing of Replication-Dependent Histone Pre-mRNAs pathway
snRNP Assembly pathway
mRNA Splicing - Minor Pathway pathway
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KEGG |
Spliceosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P62307 | ||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q497K3 Q6NZQ3 | ||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 69878 | ||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.34095 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_027246 XM_006537099 XM_006539426 XM_006543919 | ||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS48672 | ||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1917128 | ||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Snrpf | ||||||||||||||||||||||||
EMBL | AK008240 BC066015 BC100499 CH466539 | ||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH66015 AAI00500 BAB25551 EDL21562 | ||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 102638183 69878 | ||||||||||||||||||||||||