Mus musculus Gene: Tsn | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-186779.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Tsn | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | translin | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2610034C24Rik; AU040286; C3PO; TB-RBP | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000026374 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
translin
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000211460:
This gene encodes a DNA-binding protein which specifically recognizes conserved target sequences at the breakpoint junction of chromosomal translocations. Translin polypeptides form a multimeric structure that is responsible for its DNA-binding activity. Recombination-associated motifs and translin-binding sites are present at recombination hotspots and may serve as indicators of breakpoints in genes which are fused by translocations. These binding activities may play a crucial role in chromosomal translocation in lymphoid neoplasms. This protein encoded by this gene, when complexed with translin-associated protein X, also forms a Mg ion-dependent endoribonuclease that promotes RNA-induced silencing complex (RISC) activation. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, May 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:118294778-118311739 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | E2.3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 4 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 22 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Gene Expression pathway
Regulatory RNA pathways pathway
Small interfering RNA (siRNA) biogenesis pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Small interfering RNA (siRNA) biogenesis pathway
Gene Expression pathway
Regulatory RNA pathways pathway
Gene Expression pathway
Small interfering RNA (siRNA) biogenesis pathway
Regulatory RNA pathways pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_011650 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS35690 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||