Mus musculus Gene: Pmel | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-198208.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Pmel | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | premelanosome protein | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | D10H12S53E; D12S53Eh; gp100; gp87; Pmel17; Si; Silv | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000025359 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
premelanosome protein
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000185664:
This gene encodes a melanocyte-specific type I transmembrane glycoprotein. The encoded protein is enriched in melanosomes, which are the melanin-producing organelles in melanocytes, and plays an essential role in the structural organization of premelanosomes. This protein is involved in generating internal matrix fibers that define the transition from Stage I to Stage II melanosomes. This protein undergoes a complex pattern of prosttranslational processing and modification that is essential to the proper functioning of the protein. A secreted form of this protein that is released by proteolytic ectodomain shedding may be used as a melanoma-specific serum marker. Alternate splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jan 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 10:128706258-128720238 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | D3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q9CZB2 Q9QY70 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 20431 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.16756 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_021882 XM_006513405 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS36091 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:98301 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Pmel | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AC117232 AC131081 AF118450 AK012808 AK131956 BC082555 CH466578 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAF19760 AAH82555 BAB28486 BAE20900 EDL24601 EDL24602 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 20431 | ||||||||||||||||||||||