Homo sapiens Gene: RFX2 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-21095.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | RFX2 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | regulatory factor X, 2 (influences HLA class II expression) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000087903 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
regulatory factor X, 2 (influences HLA class II expression)
regulatory factor X, 2 (influences HLA class II expression)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene is a member of the regulatory factor X gene family, which encodes transcription factors that contain a highly-conserved winged helix DNA binding domain. The protein encoded by this gene is structurally related to regulatory factors X1, X3, X4, and X5. It is a transcriptional activator that can bind DNA as a monomer or as a heterodimer with other RFX family members. This protein can bind to cis elements in the promoter of the IL-5 receptor alpha gene. Two transcript variants encoding different isoforms have been described for this gene, and both variants utilize alternative polyadenylation sites. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 19:5993164-6199572 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | p13.3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 5 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.465709 Hs.624636 Hs.659115 Hs.677653 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_000635 NM_134433 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS12157 CCDS12158 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 00824 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||