Homo sapiens Gene: ITGA9 | |||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-25124.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | ITGA9 | ||||||||||||||||||
Gene Name | integrin, alpha 9 | ||||||||||||||||||
Synonyms | ALPHA-RLC; ITGA4L; RLC | ||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000144668 | ||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
integrin, alpha 9
integrin, alpha 9
integrin, alpha 9
|
||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes an alpha integrin. Integrins are heterodimeric integral membrane glycoproteins composed of an alpha chain and a beta chain that mediate cell-cell and cell-matrix adhesion. The protein encoded by this gene, when bound to the beta 1 chain, forms an integrin that is a receptor for VCAM1, cytotactin and osteopontin. Expression of this gene has been found to be upregulated in small cell lung cancers. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 3:37452115-37823514 | ||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||
Band | p22.2 | ||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 6 experimentally validated interaction(s) in this database.
|
||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||
REACTOME |
Integrin cell surface interactions pathway
Signal transduction by L1 pathway
L1CAM interactions pathway
Developmental Biology pathway
Extracellular matrix organization pathway
Axon guidance pathway
ECM proteoglycans pathway
|
||||||||||||||||||
KEGG |
Regulation of actin cytoskeleton pathway
Cell adhesion molecules (CAMs) pathway
ECM-receptor interaction pathway
Focal adhesion pathway
Arrhythmogenic right ventricular cardiomyopathy (ARVC) pathway
Hypertrophic cardiomyopathy (HCM) pathway
Dilated cardiomyopathy pathway
|
||||||||||||||||||
INOH |
Integrin signaling pathway pathway
|
||||||||||||||||||
PID NCI |
Beta1 integrin cell surface interactions
Integrin family cell surface interactions
Alpha9 beta1 integrin signaling events
|
||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
UniGene | Hs.113157 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NM_002207 | ||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||
CCDS | CCDS2669 | ||||||||||||||||||
HPRD | 04910 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||