Homo sapiens Gene: SNRPD3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-2890.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SNRPD3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | small nuclear ribonucleoprotein D3 polypeptide 18kDa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Sm-D3; SMD3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000100028 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
small nuclear ribonucleoprotein D3 polypeptide 18kDa
small nuclear ribonucleoprotein D3 polypeptide 18kDa
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene belongs to the small nuclear ribonucleoprotein core protein family. It is required for pre-mRNA splicing and small nuclear ribonucleoprotein biogenesis. [provided by RefSeq, Jul 2008] This gene encodes a core component of the spliceosome, which is a nuclear ribonucleoprotein complex that functions in pre-mRNA splicing. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jul 2013] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 22:24555503-24609980 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q11.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 117 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
snRNP Assembly pathway
SLBP independent Processing of Histone Pre-mRNAs pathway
SLBP Dependent Processing of Replication-Dependent Histone Pre-mRNAs pathway
mRNA Splicing - Major Pathway pathway
mRNA Splicing - Minor Pathway pathway
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA pathway
Cleavage of Growing Transcript in the Termination Region pathway
RNA Polymerase II Transcription Termination pathway
RNA Polymerase II Transcription pathway
Metabolism of non-coding RNA pathway
Processing of Capped Intronless Pre-mRNA pathway
mRNA Splicing pathway
Gene Expression pathway
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KEGG |
Systemic lupus erythematosus pathway
Spliceosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P62318 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 6634 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.356549 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001278656 NM_004175 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:11160 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 601062 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS13828 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 03039 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB451249 AB451373 BC000457 BC003150 CH471095 CR456583 U15009 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA57034 AAH00457 AAH03150 BAG70063 BAG70187 CAG30469 EAW59670 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 6634 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||