Homo sapiens Gene: HERC5 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-29776.7 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | HERC5 | ||||||||||||||||||
Gene Name | HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 5 | ||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000138646 | ||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
hect domain and RLD 5
hect domain and RLD 5
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Protein Structure | |||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||
Summary |
HERC5 positively regulates the innate antiviral responses by sustaining IRF3 activation via a novel post-translational modification, ISGylation.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||
Summary |
This gene is a member of the HERC family of ubiquitin ligases and encodes a protein with a HECT domain and five RCC1 repeats. Pro-inflammatory cytokines upregulate expression of this gene in endothelial cells. The protein localizes to the cytoplasm and perinuclear region and functions as an interferon-induced E3 protein ligase that mediates ISGylation of protein targets. The gene lies in a cluster of HERC family genes on chromosome 4. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 4:88457117-88506163 | ||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||
Band | q22.1 | ||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 24 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||
No orthologs found for this gene | |||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||
REACTOME |
Negative regulators of RIG-I/MDA5 signaling pathway
RIG-I/MDA5 mediated induction of IFN-alpha/beta pathways pathway
ISG15 antiviral mechanism pathway
Antiviral mechanism by IFN-stimulated genes pathway
Cytokine Signaling in Immune system pathway
Innate Immune System pathway
Interferon Signaling pathway
Immune System pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||
TrEMBL | E9PBL0 | ||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | 51191 | ||||||||||||||||||
UniGene | Hs.26663 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NM_016323 | ||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:24368 | ||||||||||||||||||
OMIM | 608242 | ||||||||||||||||||
CCDS | CCDS3630 | ||||||||||||||||||
HPRD | 10502 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | AC083829 | ||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 51191 | ||||||||||||||||||