Homo sapiens Gene: XCR1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-30030.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | XCR1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | chemokine (C motif) receptor 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | CCXCR1; GPR5 | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000173578 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
chemokine (C motif) receptor 1
chemokine (C motif) receptor 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is a chemokine receptor belonging to the G protein-coupled receptor superfamily. The family members are characterized by the presence of 7 transmembrane domains and numerous conserved amino acids. This receptor is most closely related to RBS11 and the MIP1-alpha/RANTES receptor. It transduces a signal by increasing the intracellular calcium ions level. The viral macrophage inflammatory protein-II is an antagonist of this receptor and blocks signaling. Two alternatively spliced transcript variants encoding the same protein have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 3:46017024-46027742 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | p21.31 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
G alpha (q) signalling events pathway
Gastrin-CREB signalling pathway via PKC and MAPK pathway
Chemokine receptors bind chemokines pathway
Peptide ligand-binding receptors pathway
Class A/1 (Rhodopsin-like receptors) pathway
Signaling by GPCR pathway
Signal Transduction pathway
GPCR downstream signaling pathway
GPCR ligand binding pathway
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KEGG |
Cytokine-cytokine receptor interaction pathway
Chemokine signaling pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | P46094 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q689E2 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 2829 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.128375 Hs.248116 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001024644 NM_005283 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:1625 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 600552 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS2736 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 02774 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AB189434 AB189435 AC099782 AC133140 AY275469 BC069075 BC069589 L36149 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA62837 AAH69075 AAH69589 AAP32301 BAD38891 BAD38892 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 2829 | ||||||||||||||||||||||