Homo sapiens Gene: MYOD1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-34281.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | MYOD1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | myogenic differentiation 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | bHLHc1; MYF3; MYOD; PUM | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000129152 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
myogenic differentiation 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a nuclear protein that belongs to the basic helix-loop-helix family of transcription factors and the myogenic factors subfamily. It regulates muscle cell differentiation by inducing cell cycle arrest, a prerequisite for myogenic initiation. The protein is also involved in muscle regeneration. It activates its own transcription which may stabilize commitment to myogenesis. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 11:17719568-17722131 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | p15.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 106 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 43 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
ID pathway
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REACTOME |
CDO in myogenesis pathway
Developmental Biology pathway
Myogenesis pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Regulation of retinoblastoma protein
Notch-mediated HES/HEY network
C-MYB transcription factor network
Regulation of nuclear SMAD2/3 signaling
Signaling events mediated by HDAC Class III
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P15172 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 4654 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.181768 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_002478 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:7611 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 159970 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS7826 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AF027148 BC064493 BT007157 CH471064 X17650 X56677 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC29001 AAH64493 AAP35821 CAA35640 CAA40000 EAW68427 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 4654 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||