Homo sapiens Gene: SLC23A1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-47666.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SLC23A1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | solute carrier family 23 (nucleobase transporters), member 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | SLC23A2; SVCT1; YSPL3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000170482 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
solute carrier family 23 (nucleobase transporters), member 1
solute carrier family 23 (nucleobase transporters), member 1
solute carrier family 23 (nucleobase transporters), member 1
solute carrier family 23 (nucleobase transporters), member 1
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The absorption of vitamin C into the body and its distribution to organs requires two sodium-dependent vitamin C transporters. This gene encodes one of the two transporters. The encoded protein is active in bulk vitamin C transport involving epithelial surfaces. Previously, this gene had an official symbol of SLC23A2. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Dec 2008] |
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 5:139367196-139384553 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q31.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Vitamin C (ascorbate) metabolism pathway
Defective HLCS causes multiple carboxylase deficiency pathway
Defective MUT causes methylmalonic aciduria mut type pathway
Defective MMAA causes methylmalonic aciduria type cblA pathway
Defective TCN2 causes hereditary megaloblastic anemia pathway
Metabolism of water-soluble vitamins and cofactors pathway
Defective AMN causes hereditary megaloblastic anemia 1 pathway
Defective MTR causes methylmalonic aciduria and homocystinuria type cblG pathway
Defective LMBRD1 causes methylmalonic aciduria and homocystinuria type cblF pathway
Defective CD320 causes methylmalonic aciduria pathway
Defects in cobalamin (B12) metabolism pathway
Defective MMACHC causes methylmalonic aciduria and homocystinuria type cblC pathway
Defects in biotin (Btn) metabolism pathway
Defective BTD causes biotidinase deficiency pathway
Defective GIF causes intrinsic factor deficiency pathway
Defects in vitamin and cofactor metabolism pathway
Defective CUBN causes hereditary megaloblastic anemia 1 pathway
Defective MMADHC causes methylmalonic aciduria and homocystinuria type cblD pathway
Defective MTRR causes methylmalonic aciduria and homocystinuria type cblE pathway
Metabolism pathway
Defective MMAB causes methylmalonic aciduria type cblB pathway
Disease pathway
Metabolism of vitamins and cofactors pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | H0YAJ1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 9963 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.643467 Hs.739242 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_005847 NM_152685 XM_005272148 XM_005272149 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:10974 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 603790 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS4212 CCDS4213 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 04810 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC135457 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 9963 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||