Homo sapiens Gene: FOXA1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-5104.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | FOXA1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | forkhead box A1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | HNF3A; TCF3A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000129514 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
forkhead box A1
forkhead box A1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a member of the forkhead class of DNA-binding proteins. These hepatocyte nuclear factors are transcriptional activators for liver-specific transcripts such as albumin and transthyretin, and they also interact with chromatin. Similar family members in mice have roles in the regulation of metabolism and in the differentiation of the pancreas and liver. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 14:37589984-37596059 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q21.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 23 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 23 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
AndrogenReceptor pathway
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REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
FOXA2 and FOXA3 transcription factor networks
Direct p53 effectors
FOXA transcription factor networks
FOXA1 transcription factor network
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P55317 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | G3V4B9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 3169 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.163484 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_004496 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:5021 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 602294 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS9665 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AF176111 AF176112 AF303742 AF303743 AK313785 AK316360 AL121790 BC033890 CH471078 U39840 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAB06493 AAD51979 AAG40847 AAH33890 BAG36523 BAH14731 EAW65844 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 3169 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||