Homo sapiens Protein: FOXA1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-5106.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | FOXA1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | forkhead box A1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | HNF3A; TCF3A; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000250448 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-5104 (FOXA1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Transcription factor that is involved in embryonic development, establishment of tissue-specific gene expression and regulation of gene expression in differentiated tissues. Is thought to act as a 'pioneer' factor opening the compacted chromatin for other proteins through interactions with nucleosomal core histones and thereby replacing linker histones at target enhancer and/or promoter sites. Binds DNA with the consensus sequence 5'-[AC]A[AT]T[AG]TT[GT][AG][CT]T[CT]-3' (By similarity). Proposed to play a role in translating the epigenetic signatures into cell type-specific enhancer-driven transcriptional programs. Its differential recruitment to chromatin is dependent on distribution of histone H3 methylated at 'Lys-5' (H3K4me2) in estrogen-regulated genes. Involved in the development of multiple endoderm-derived organ systems such as liver, pancreas, lung and prostate; FOXA1 and FOXA2 seem to have at least in part redundant roles (By similarity). Modulates the transcriptional activity of nuclear hormone receptors. Is involved in ESR1-mediated transcription; required for ESR1 binding to the NKX2-1 promoter in breast cancer cells; binds to the RPRM promter and is required for the estrogen-induced repression of RPRM. Involved in regulation of apoptosis by inhibiting the expression of BCL2. Involved in cell cycle regulation by activating expression of CDKN1B, alone or in conjunction with BRCA1. Originally described as a transcription activator for a number of liver genes such as AFP, albumin, tyrosine aminotransferase, PEPCK, etc. Interacts with the cis- acting regulatory regions of these genes. Involved in glucose homeostasis. {ECO:0000250, ECO:0000269PubMed:16087863, ECO:0000269PubMed:16331276, ECO:0000269PubMed:18358809, ECO:0000269PubMed:19127412, ECO:0000269PubMed:19917725}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000255PROSITE- ProRule:PRU00089, ECO:0000269PubMed:15987773, ECO:0000269PubMed:16331276}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Highly expressed in prostate and ESR1-positive breast tumors. Overexpressed in esophageal and lung adenocarcinomas. {ECO:0000269PubMed:12234996, ECO:0000269PubMed:15987773, ECO:0000269PubMed:16331276}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 23 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 23 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001766
Transcription factor, fork head IPR013638 Fork-head N-terminal IPR018533 Forkhead box protein, C-terminal |
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PFAM |
PF00250
PF08430 PF09354 |
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PRINTS |
PR00053
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00339
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P55317 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P55317 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 3169 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.163484 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_004487 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:5021 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 602294 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS9665 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 03801 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AF176111 AF176112 AF303742 AF303743 AK313785 AK316360 AL121790 BC033890 CH471078 U39840 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAB06493 AAD51979 AAG40847 AAH33890 BAG36523 BAH14731 EAW65844 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||