Homo sapiens Gene: BCOR | |||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-56665.6 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | BCOR | ||||||||||||||||||||||||
Gene Name | BCL6 corepressor | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000183337 | ||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
BCL6 corepressor
BCL6 corepressor
BCL6 corepressor
BCL6 corepressor
BCL6 corepressor
BCL6 corepressor
BCL6 corepressor
BCL6 corepressor
BCL6 corepressor
BCL6 corepressor
BCL6 corepressor
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene was identified as an interacting corepressor of BCL6, a POZ/zinc finger transcription repressor that is required for germinal center formation and may influence apoptosis. This protein selectively interacts with the POZ domain of BCL6, but not with eight other POZ proteins. Specific class I and II histone deacetylases (HDACs) have been shown to interact with this protein, which suggests a possible link between the two classes of HDACs. Several transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. A pseudogene of this gene is found on chromosome Y.[provided by RefSeq, Jun 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome X:40049815-40177329 | ||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||
Band | p11.4 | ||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 38 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 5 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Signaling events mediated by HDAC Class II
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.186424 Hs.618974 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001123383 NM_001123384 NM_001123385 NM_017745 XM_005272616 XM_005272617 XM_005272618 XM_005272620 XM_006724536 | ||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS14250 CCDS48092 CCDS48093 | ||||||||||||||||||||||||
HPRD | 06458 | ||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||