Bos taurus Gene: BCOR | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-638074.3 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | BCOR | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | BCL-6 corepressor | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000047339 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
BCL6 corepressor
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000183337:
The protein encoded by this gene was identified as an interacting corepressor of BCL6, a POZ/zinc finger transcription repressor that is required for germinal center formation and may influence apoptosis. This protein selectively interacts with the POZ domain of BCL6, but not with eight other POZ proteins. Specific class I and II histone deacetylases (HDACs) have been shown to interact with this protein, which suggests a possible link between the two classes of HDACs. Several transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. A pseudogene of this gene is found on chromosome Y.[provided by RefSeq, Jun 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome X:108883915-108907652 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 23 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Signaling events mediated by HDAC Class II
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | G3X8E4 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 784529 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.18938 Bt.36170 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001191544 XM_002706030 XM_005199834 XM_005199835 XM_005199836 XM_005199837 XM_005199838 XM_005199839 XM_005199840 XM_005228295 XM_005228296 XM_005228297 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:20893 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | DAAA02073654 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 541088 784529 | ||||||||||||||||||||||
Transcript Frequencies | |||||||||||||||||||||||
Tag Count based mRNA-Abundances across 87 different Tissues (TPM).
Based on Data from Bovine Gene Atlas |
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