Homo sapiens Gene: TPCN2 | |||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-61770.6 | ||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||
Gene Symbol | TPCN2 | ||||||||||||||||||||
Gene Name | two pore segment channel 2 | ||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000162341 | ||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
two pore segment channel 2
two pore segment channel 2
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a putative cation-selective ion channel with two repeats of a six-transmembrane-domain. The protein localizes to lysosomal membranes and enables nicotinic acid adenine dinucleotide phosphate (NAADP) -induced calcium ion release from lysosome-related stores. This ubiquitously expressed gene has elevated expression in liver and kidney. Two common nonsynonymous SNPs in this gene strongly associate with blond versus brown hair pigmentation.[provided by RefSeq, Dec 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 11:69048897-69090604 | ||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||
Band | q13.3 | ||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 4 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||
REACTOME |
Stimuli-sensing channels pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
Ion channel transport pathway
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KEGG |
Pancreatic secretion pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_139075 XM_005273824 XM_005273828 XM_006718454 XM_006718456 | ||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS8189 | ||||||||||||||||||||
HPRD | 18218 | ||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||