Bos taurus Gene: BT.55196 | |||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-628758.3 | ||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | BT.55196 | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23 | ||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000009519 | ||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
GTP-binding protein ARD-1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] TRIM23 mediates K(lys)-27-ubiquitin conjugation to IKBKG (NEMO) which is essential for TLR3- and RIG-I/MDA5-mediated antiviral innate and inflammatory responses.
[Homo sapiens] TRIM23 was identified in a systematic screen for positive regulators of innate immune responses.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000113595:
The protein encoded by this gene is a member of the tripartite motif (TRIM) family. The TRIM motif includes three zinc-binding domains, a RING, a B-box type 1 and a B-box type 2, and a coiled-coil region. This protein is also a member of the ADP ribosylation factor family of guanine nucleotide-binding family of proteins. Its carboxy terminus contains an ADP-ribosylation factor domain and a guanine nucleotide binding site, while the amino terminus contains a GTPase activating protein domain which acts on the guanine nucleotide binding site. The protein localizes to lysosomes and the Golgi apparatus. It plays a role in the formation of intracellular transport vesicles, their movement from one compartment to another, and phopholipase D activation. Three alternatively spliced transcript variants for this gene have been described. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 20:13891748-13925788 | ||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 47 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.55196 | ||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001080303 | ||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||