Bos taurus Gene: CCRN4L | |||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-629822.3 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | CCRN4L | ||||||||||||||||||||||||
Gene Name | nocturnin | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | NOC | ||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000005998 | ||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
nocturnin
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000151014:
The protein encoded by this gene is highly similar to Nocturnin, a gene identified as a circadian clock regulated gene in Xenopus laevis. This protein and Nocturnin protein share similarity with the C-terminal domain of a yeast transcription factor, carbon catabolite repression 4 (CCR4). The mRNA abundance of a similar gene in mouse has been shown to exhibit circadian rhythmicity, which suggests a role for this protein in clock function or as a circadian clock effector. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 17:18892763-18910926 | ||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
BMAL1:CLOCK,NPAS2 activates circadian gene expression pathway
Circadian Clock pathway
Circadian Clock pathway
BMAL1:CLOCK,NPAS2 activates circadian gene expression pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | A2VE74 A6QPV9 | ||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 540641 | ||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.27843 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001082454 | ||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
EMBL | BC133608 BC149515 DAAA02044446 | ||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAI33609 AAI49516 | ||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 540641 | ||||||||||||||||||||||||