Bos taurus Gene: APP | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-630293.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | APP | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | Amyloid beta A4 protein Soluble APP-beta CTF-alpha Beta-amyloid protein 42 Beta-amyloid protein 40 Gamma-secretase C-terminal fragment 59 Gamma-secretase C-terminal fragment 57 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000017753 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
Amyloid beta A4 proteinSoluble APP-betaCTF-alphaBeta-amyloid protein 42Beta-amyloid protein 40Gamma-secretase C-terminal fragment 59Gamma-secretase C-terminal fragment 57
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000142192:
This gene encodes a cell surface receptor and transmembrane precursor protein that is cleaved by secretases to form a number of peptides. Some of these peptides are secreted and can bind to the acetyltransferase complex APBB1/TIP60 to promote transcriptional activation, while others form the protein basis of the amyloid plaques found in the brains of patients with Alzheimer disease. Mutations in this gene have been implicated in autosomal dominant Alzheimer disease and cerebroarterial amyloidosis (cerebral amyloid angiopathy). Multiple transcript variants encoding several different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] This gene encodes a cell surface receptor and transmembrane precursor protein that is cleaved by secretases to form a number of peptides. Some of these peptides are secreted and can bind to the acetyltransferase complex APBB1/TIP60 to promote transcriptional activation, while others form the protein basis of the amyloid plaques found in the brains of patients with Alzheimer disease. In addition, two of the peptides are antimicrobial peptides, having been shown to have bacteriocidal and antifungal activities. Mutations in this gene have been implicated in autosomal dominant Alzheimer disease and cerebroarterial amyloidosis (cerebral amyloid angiopathy). Multiple transcript variants encoding several different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2014] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:9607382-9921004 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1740 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Platelet degranulation pathway
Toll Like Receptor 2 (TLR2) Cascade pathway
TRIF-mediated TLR3/TLR4 signaling pathway
Gastrin-CREB signalling pathway via PKC and MAPK pathway
Toll Like Receptor 3 (TLR3) Cascade pathway
Signaling by GPCR pathway
Activated TLR4 signalling pathway
Toll Like Receptor 7/8 (TLR7/8) Cascade pathway
MyD88-independent cascade pathway
Inflammasomes pathway
Cytosolic sensors of pathogen-associated DNA pathway
Amyloids pathway
The NLRP3 inflammasome pathway
Toll Like Receptor 9 (TLR9) Cascade pathway
Extracellular matrix organization pathway
RIG-I/MDA5 mediated induction of IFN-alpha/beta pathways pathway
MyD88:Mal cascade initiated on plasma membrane pathway
Toll Like Receptor 5 (TLR5) Cascade pathway
DEx/H-box helicases activate type I IFN and inflammatory cytokines production pathway
Hemostasis pathway
Immune System pathway
Platelet activation, signaling and aggregation pathway
Response to elevated platelet cytosolic Ca2+ pathway
G alpha (i) signalling events pathway
Toll-Like Receptors Cascades pathway
Signal Transduction pathway
TRAF6 mediated NF-kB activation pathway
Nucleotide-binding domain, leucine rich repeat containing receptor (NLR) signaling pathways pathway
Toll Like Receptor 10 (TLR10) Cascade pathway
Toll Like Receptor TLR6:TLR2 Cascade pathway
Advanced glycosylation endproduct receptor signaling pathway
G alpha (q) signalling events pathway
TRAF6 mediated induction of NFkB and MAP kinases upon TLR7/8 or 9 activation pathway
GPCR downstream signaling pathway
Toll Like Receptor TLR1:TLR2 Cascade pathway
MyD88 dependent cascade initiated on endosome pathway
ECM proteoglycans pathway
TAK1 activates NFkB by phosphorylation and activation of IKKs complex pathway
Innate Immune System pathway
ZBP1(DAI) mediated induction of type I IFNs pathway
RIP-mediated NFkB activation via ZBP1 pathway
Disease pathway
Toll Like Receptor 4 (TLR4) Cascade pathway
MyD88 cascade initiated on plasma membrane pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
Notch pathway
EGFR1 pathway
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REACTOME |
RIP-mediated NFkB activation via ZBP1 pathway
ZBP1(DAI) mediated induction of type I IFNs pathway
TRAF6 mediated NF-kB activation pathway
RIG-I/MDA5 mediated induction of IFN-alpha/beta pathways pathway
Advanced glycosylation endproduct receptor signaling pathway
TAK1 activates NFkB by phosphorylation and activation of IKKs complex pathway
MyD88-independent cascade pathway
Toll Like Receptor 3 (TLR3) Cascade pathway
MyD88:Mal cascade initiated on plasma membrane pathway
Toll Like Receptor TLR1:TLR2 Cascade pathway
Toll Like Receptor TLR6:TLR2 Cascade pathway
TRAF6 mediated induction of NFkB and MAP kinases upon TLR7/8 or 9 activation pathway
MyD88 dependent cascade initiated on endosome pathway
Toll Like Receptor 9 (TLR9) Cascade pathway
MyD88 cascade initiated on plasma membrane pathway
Toll Like Receptor 10 (TLR10) Cascade pathway
Toll Like Receptor 4 (TLR4) Cascade pathway
Toll Like Receptor 5 (TLR5) Cascade pathway
The NLRP3 inflammasome pathway
Inflammasomes pathway
Platelet degranulation pathway
Response to elevated platelet cytosolic Ca2+ pathway
G alpha (q) signalling events pathway
Gastrin-CREB signalling pathway via PKC and MAPK pathway
G alpha (i) signalling events pathway
Formyl peptide receptors bind formyl peptides and many other ligands pathway
Peptide ligand-binding receptors pathway
Class A/1 (Rhodopsin-like receptors) pathway
Amyloids pathway
Toll Like Receptor 7/8 (TLR7/8) Cascade pathway
Extracellular matrix organization pathway
Signaling by GPCR pathway
Innate Immune System pathway
Platelet activation, signaling and aggregation pathway
Toll Like Receptor 2 (TLR2) Cascade pathway
Toll-Like Receptors Cascades pathway
Signal Transduction pathway
GPCR downstream signaling pathway
Nucleotide-binding domain, leucine rich repeat containing receptor (NLR) signaling pathways pathway
DEx/H-box helicases activate type I IFN and inflammatory cytokines production pathway
Immune System pathway
ECM proteoglycans pathway
Activated TLR4 signalling pathway
GPCR ligand binding pathway
TRIF-mediated TLR3/TLR4 signaling pathway
Cytosolic sensors of pathogen-associated DNA pathway
Disease pathway
Hemostasis pathway
TRAF6 mediated NF-kB activation pathway
Platelet degranulation pathway
Toll Like Receptor 3 (TLR3) Cascade pathway
TRAF6 mediated induction of NFkB and MAP kinases upon TLR7/8 or 9 activation pathway
Toll Like Receptor 2 (TLR2) Cascade pathway
Innate Immune System pathway
GPCR downstream signaling pathway
Disease pathway
Hemostasis pathway
Signaling by GPCR pathway
Class A/1 (Rhodopsin-like receptors) pathway
MyD88 cascade initiated on plasma membrane pathway
Amyloids pathway
Gastrin-CREB signalling pathway via PKC and MAPK pathway
Toll Like Receptor TLR1:TLR2 Cascade pathway
ZBP1(DAI) mediated induction of type I IFNs pathway
Immune System pathway
Extracellular matrix organization pathway
Platelet activation, signaling and aggregation pathway
Toll Like Receptor 5 (TLR5) Cascade pathway
Toll Like Receptor TLR6:TLR2 Cascade pathway
The NLRP3 inflammasome pathway
Advanced glycosylation endproduct receptor signaling pathway
Toll Like Receptor 9 (TLR9) Cascade pathway
Inflammasomes pathway
GPCR ligand binding pathway
Peptide ligand-binding receptors pathway
DEx/H-box helicases activate type I IFN and inflammatory cytokines production pathway
Toll-Like Receptors Cascades pathway
MyD88 dependent cascade initiated on endosome pathway
Cytosolic sensors of pathogen-associated DNA pathway
G alpha (i) signalling events pathway
RIP-mediated NFkB activation via ZBP1 pathway
ECM proteoglycans pathway
Nucleotide-binding domain, leucine rich repeat containing receptor (NLR) signaling pathways pathway
Activated TLR4 signalling pathway
G alpha (q) signalling events pathway
Response to elevated platelet cytosolic Ca2+ pathway
MyD88-independent cascade pathway
Signal Transduction pathway
RIG-I/MDA5 mediated induction of IFN-alpha/beta pathways pathway
Toll Like Receptor 7/8 (TLR7/8) Cascade pathway
MyD88:Mal cascade initiated on plasma membrane pathway
TRIF-mediated TLR3/TLR4 signaling pathway
TAK1 activates NFkB by phosphorylation and activation of IKKs complex pathway
Formyl peptide receptors bind formyl peptides and many other ligands pathway
Toll Like Receptor 10 (TLR10) Cascade pathway
Toll Like Receptor 4 (TLR4) Cascade pathway
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KEGG |
Alzheimer's disease pathway
Alzheimer's disease pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Caspase Cascade in Apoptosis
Glypican 1 network
p75(NTR)-mediated signaling
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.107196 Bt.34436 Bt.40062 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001076796 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||