Bos taurus Gene: SCN8A | |||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-632185.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SCN8A | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | sodium channel protein type 8 subunit alpha | ||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000021339 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
sodium channel, voltage gated, type VIII, alpha subunit
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000196876:
This gene encodes a member of the sodium channel alpha subunit gene family. The encoded protein forms the ion pore region of the voltage-gated sodium channel. This protein is essential for the rapid membrane depolarization that occurs during the formation of the action potential in excitable neurons. Mutations in this gene are associated with mental retardation, pancerebellar atrophy and ataxia. Alternate splicing results in multiple transcript variants.[provided by RefSeq, May 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 5:28211640-28331404 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Interaction between L1 and Ankyrins pathway
L1CAM interactions pathway
Developmental Biology pathway
Axon guidance pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | F1MMU9 | ||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 537277 | ||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.41157 | ||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001193102 XM_005206229 XM_005206230 | ||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:10596 | ||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | DAAA02012901 | ||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 537277 | ||||||||||||||||||||||||||||||