Bos taurus Gene: TNNT2 | |||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-634165.2 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | TNNT2 | ||||||||||||||||||||||||
Gene Name | troponin T, cardiac muscle | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000045789 | ||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
troponin T, cardiac muscle
troponin T, cardiac muscle
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000118194:
The protein encoded by this gene is the tropomyosin-binding subunit of the troponin complex, which is located on the thin filament of striated muscles and regulates muscle contraction in response to alterations in intracellular calcium ion concentration. Mutations in this gene have been associated with familial hypertrophic cardiomyopathy as well as with dilated cardiomyopathy. Transcripts for this gene undergo alternative splicing that results in many tissue-specific isoforms, however, the full-length nature of some of these variants has not yet been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 16:49259287-49262028 | ||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Striated Muscle Contraction pathway
Muscle contraction pathway
Striated Muscle Contraction pathway
Muscle contraction pathway
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KEGG |
Hypertrophic cardiomyopathy (HCM) pathway
Cardiac muscle contraction pathway
Dilated cardiomyopathy pathway
Cardiac muscle contraction pathway
Hypertrophic cardiomyopathy (HCM) pathway
Dilated cardiomyopathy pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | G3N264 | ||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 286816 | ||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.3879 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_174771 | ||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
EMBL | DAAA02043120 | ||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 286816 | ||||||||||||||||||||||||
Transcript Frequencies | |||||||||||||||||||||||||
Tag Count based mRNA-Abundances across 87 different Tissues (TPM).
Based on Data from Bovine Gene Atlas |
(Move your mouse over the image to view a more detailed version) |
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