Bos taurus Gene: ARNTL2 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-638680.3 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | ARNTL2 | ||||||||||||||||||
Gene Name | Uncharacterized protein | ||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000011804 | ||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator-like 2
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Protein Structure | |||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a basic helix-loop-helix transcription factor belonging to the PAS (PER, ARNT, SIM) superfamily. The PAS proteins play important roles in adaptation to low atmospheric and cellular oxygen levels, exposure to certain environmental pollutants, and diurnal oscillations in light and temperature. This protein forms a transcriptionally active heterodimer with the circadian CLOCK protein, the structurally related MOP4, and hypoxia-inducible factors, such as HIF1alpha. Consistent with its role as a biologically relevant partner of circadian and hypoxia factors, this protein is coexpressed in regions of the brain such as the thalamus, hypothalamus, and amygdala. [provided by RefSeq, Feb 2014] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 5:82875251-82939156 | ||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 3 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||
REACTOME |
BMAL1:CLOCK,NPAS2 activates circadian gene expression pathway
Circadian Clock pathway
Circadian Clock pathway
BMAL1:CLOCK,NPAS2 activates circadian gene expression pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||
TrEMBL | F1N4Q7 | ||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | 535794 | ||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||
RefSeq | XM_002687728 XM_615908 | ||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:18984 | ||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | DAAA02014003 | ||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 535794 | ||||||||||||||||||