Bos taurus Gene: YBX1 | |||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-640558.2 | ||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||
Gene Symbol | YBX1 | ||||||||||||||||||||
Gene Name | nuclease-sensitive element-binding protein 1 | ||||||||||||||||||||
Synonyms | NSEP1; YB1 | ||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000017368 | ||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
nuclease-sensitive element-binding protein 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||
Summary |
[Mus musculus] Ybx1 controls intracellular Il6 mRNA levels in a cell type-specific manner, leading to functions that are dependent on the extracellular and intracellular distribution of Ybx1.
[Mus musculus] Bacterial cell wall glucosaminyl-muramyl dipeptides (GMDPs) bind to the transcription factor Ybx1 to upregulate Nfkb2 and Cxcr4 gene expression.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000065978:
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Gene Information | |||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 3:104112934-104133708 | ||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 156 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||
NETPATH |
IL2 pathway
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REACTOME |
mRNA Splicing - Major Pathway pathway
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA pathway
mRNA Splicing pathway
Gene Expression pathway
mRNA Splicing pathway
Gene Expression pathway
mRNA Splicing - Major Pathway pathway
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||
PID NCI |
Signaling events mediated by PTP1B
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Cross-References | |||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||
TrEMBL | F1MZ92 | ||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 287023 | ||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.5332 | ||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_174815 | ||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||
EMBL | DAAA02009073 DAAA02009074 DAAA02009075 | ||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 287023 | ||||||||||||||||||||