Homo sapiens Gene: VPS39 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-7574.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | VPS39 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | vacuolar protein sorting 39 homolog (S. cerevisiae) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | hVam6p; TLP; VAM6 | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000166887 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
vacuolar protein sorting 39 homolog (S. cerevisiae)
vacuolar protein sorting 39 homolog (S. cerevisiae)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a protein that may promote clustering and fusion of late endosomes and lysosomes. The protein may also act as an adaptor protein that modulates the transforming growth factor-beta response by coupling the transforming growth factor-beta receptor complex to the Smad pathway. [provided by RefSeq, Jul 2008] This gene encodes a protein that may promote clustering and fusion of late endosomes and lysosomes. The protein may also act as an adaptor protein that modulates the transforming growth factor-beta response by coupling the transforming growth factor-beta receptor complex to the Smad pathway. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jul 2014] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 15:42158701-42208316 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q15.1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 13 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH |
TGF_beta_Receptor pathway
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REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.603177 Hs.88025 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001301138 NM_015289 XM_005254259 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS10083 CCDS73710 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 10300 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||