Homo sapiens Gene: MDC1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-76700.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | MDC1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | mediator of DNA-damage checkpoint 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | NFBD1 | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000137337 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
mediator of DNA-damage checkpoint 1
mediator of DNA-damage checkpoint 1
mediator of DNA-damage checkpoint 1
mediator of DNA-damage checkpoint 1
mediator of DNA-damage checkpoint 1
mediator of DNA-damage checkpoint 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene contains an N-terminal forkhead domain, two BRCA1 C-terminal (BRCT) motifs and a central domain with 13 repetitions of an approximately 41-amino acid sequence. The encoded protein is required to activate the intra-S phase and G2/M phase cell cycle checkpoints in response to DNA damage. This nuclear protein interacts with phosphorylated histone H2AX near sites of DNA double-strand breaks through its BRCT motifs, and facilitates recruitment of the ATM kinase and meiotic recombination 11 protein complex to DNA damage foci. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 6:30699807-30717889 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | p21.33 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 225 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH |
TSLP pathway
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REACTOME |
Recruitment of repair and signaling proteins to double-strand breaks pathway
ATM mediated phosphorylation of repair proteins pathway
ATM mediated response to DNA double-strand break pathway
Homologous Recombination Repair pathway
Double-Strand Break Repair pathway
Homologous recombination repair of replication-independent double-strand breaks pathway
DNA Repair pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
ATM pathway
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 9656 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.653495 Hs.710124 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_014641 XM_005249492 XM_005249493 XM_005249494 XM_005272909 XM_005272910 XM_005275198 XM_005275321 XM_005275322 XM_006725856 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:21163 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 607593 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS34384 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 16252 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 9656 | ||||||||||||||||||||||