Homo sapiens Protein: MDC1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-76702.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | MDC1 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | mediator of DNA-damage checkpoint 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | NFBD1; | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000365588 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-76700 (MDC1) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Required for checkpoint mediated cell cycle arrest in response to DNA damage within both the S phase and G2/M phases of the cell cycle. May serve as a scaffold for the recruitment of DNA repair and signal transduction proteins to discrete foci of DNA damage marked by 'Ser-139' phosphorylation of histone H2AFX. Also required for downstream events subsequent to the recruitment of these proteins. These include phosphorylation and activation of the ATM, CHEK1 and CHEK2 kinases, and stabilization of TP53 and apoptosis. ATM and CHEK2 may also be activated independently by a parallel pathway mediated by TP53BP1. {ECO:0000269PubMed:12475977, ECO:0000269PubMed:12499369, ECO:0000269PubMed:12551934, ECO:0000269PubMed:12607003, ECO:0000269PubMed:12607004, ECO:0000269PubMed:12607005, ECO:0000269PubMed:12611903, ECO:0000269PubMed:14695167, ECO:0000269PubMed:15201865, ECO:0000269PubMed:15377652}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000269PubMed:12475977, ECO:0000269PubMed:12499369, ECO:0000269PubMed:12551934, ECO:0000269PubMed:12607003, ECO:0000269PubMed:12607004, ECO:0000269PubMed:12607005, ECO:0000269PubMed:12611903, ECO:0000269PubMed:14695167, ECO:0000269PubMed:15201865, ECO:0000269PubMed:15377652, ECO:0000269PubMed:20008512}. Chromosome {ECO:0000250}. Note=Associated with chromatin. Relocalizes to discrete nuclear foci following DNA damage, this requires 'Ser-139' phosphorylation of H2AFX. Colocalizes with APTX at sites of DNA double-strand breaks. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Highly expressed in testis. {ECO:0000269PubMed:12499369}. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 225 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000253
Forkhead-associated (FHA) domain IPR001357 BRCT domain IPR008984 SMAD/FHA domain |
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PFAM |
PF00498
PF00533 PF12738 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00240
SM00292 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q14676 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q14676 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | A2AB07 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 9656 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.710124 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_055456 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:21163 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 607593 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS34384 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 16252 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AB088099 AB103605 AB202097 AL662797 AL662848 AL845353 BA000025 BC110645 BC152556 BX248307 BX927283 CH471081 CR749828 CR759873 CR788240 CR936878 D79992 EF177821 EF177823 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAI10646 AAI52557 ABM47419 ABM47421 BAA11487 BAB63322 BAC54931 BAE78617 BAF31266 CAH18685 CAI17440 CAI18195 CAI41890 CAI41891 CAM24847 CAM25512 CAM25928 CAM25929 CAQ06769 CAQ06770 CAQ06813 CAQ06814 CAQ07571 CAQ07572 CAQ08690 CAQ08691 EAX03321 | ||||||||||||||||||||||