Homo sapiens Gene: SETX | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-90245.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SETX | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | senataxin | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | ALS4; AOA2; bA479K20.2; SCAR1 | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000107290 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
senataxin
senataxin
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a protein named for its homology to the Sen1p protein of fungi which has RNA helicase activity encoded by a domain at the C-terminal end of the protein. The protein encoded by this gene contains a DNA/RNA helicase domain at its C-terminal end which suggests that it may be involved in both DNA and RNA processing. Mutations in this gene have been associated with ataxia-ocular apraxia-2 (AOA2) and an autosomal dominant form of juvenile amyotrophic lateral sclerosis (ALS4). [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 9:132261356-132354985 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q34.13 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 10 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 3 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.460317 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_015046 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS6947 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 07622 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||