Homo sapiens Gene: RPL7A | |||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-91022.6 | ||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | RPL7A | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | ribosomal protein L7a | ||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | L7A; SURF3; TRUP | ||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000148303 | ||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
ribosomal protein L7a
ribosomal protein L7a
ribosomal protein L7a
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
Cytoplasmic ribosomes, organelles that catalyze protein synthesis, consist of a small 40S subunit and a large 60S subunit. Together these subunits are composed of 4 RNA species and approximately 80 structurally distinct proteins. This gene encodes a ribosomal protein that is a component of the 60S subunit. The protein belongs to the L7AE family of ribosomal proteins. It can interact with a subclass of nuclear hormone receptors, including thyroid hormone receptor, and inhibit their ability to transactivate by preventing their binding to their DNA response elements. This gene is included in the surfeit gene cluster, a group of very tightly linked genes that do not share sequence similarity. It is co-transcribed with the U24, U36a, U36b, and U36c small nucleolar RNA genes, which are located in its second, fifth, fourth, and sixth introns, respectively. This gene rearranges with the trk proto-oncogene to form the chimeric oncogene trk-2h, which encodes an oncoprotein consisting of the N terminus of ribosomal protein L7a fused to the receptor tyrosine kinase domain of trk. As is typical for genes encoding ribosomal proteins, there are multiple processed pseudogenes of this gene dispersed through the genome. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 9:133348214-133351426 | ||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||
Band | q34.2 | ||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 135 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||
No orthologs found for this gene | |||||||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
L13a-mediated translational silencing of Ceruloplasmin expression pathway
Nonsense Mediated Decay (NMD) independent of the Exon Junction Complex (EJC) pathway
Nonsense Mediated Decay (NMD) enhanced by the Exon Junction Complex (EJC) pathway
GTP hydrolysis and joining of the 60S ribosomal subunit pathway
Formation of a pool of free 40S subunits pathway
Eukaryotic Translation Termination pathway
Peptide chain elongation pathway
Eukaryotic Translation Elongation pathway
SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane pathway
Viral mRNA Translation pathway
Eukaryotic Translation Initiation pathway
Influenza Infection pathway
Nonsense-Mediated Decay (NMD) pathway
Influenza Viral RNA Transcription and Replication pathway
Translation pathway
Metabolism of proteins pathway
Cap-dependent Translation Initiation pathway
Influenza Life Cycle pathway
Gene Expression pathway
Disease pathway
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KEGG |
Ribosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.518936 Hs.717500 | ||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_000972 | ||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS6965 | ||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 01712 | ||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||