Homo sapiens Gene: PRDM1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-94825.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PRDM1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | PR domain containing 1, with ZNF domain | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | BLIMP1; PRDI-BF1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000057657 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
PR domain containing 1, with ZNF domain
PR domain containing 1, with ZNF domain
PR domain containing 1, with ZNF domain
PR domain containing 1, with ZNF domain
PR domain containing 1, with ZNF domain
PR domain containing 1, with ZNF domain
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Mus musculus] Prdm1 (Blimp1) modulates host defences by suppressing Ccl8-induced inflammation.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a protein that acts as a repressor of beta-interferon gene expression. The protein binds specifically to the PRDI (positive regulatory domain I element) of the beta-IFN gene promoter. Transcription of this gene increases upon virus induction. Two alternatively spliced transcript variants that encode different isoforms have been reported. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 6:106086320-106109939 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 58 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 8 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Direct p53 effectors
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | B2REA5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 639 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.436023 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001198 NM_182907 XM_005267094 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:9346 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 603423 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS34505 CCDS5054 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 04572 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AL022067 AL358952 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 639 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||