Homo sapiens Gene: TBPL1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-96757.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | TBPL1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | TBP-like 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | MGC:8389; MGC:9620; STUD; TLF; TLP; TRF2 | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000028839 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
TBP-like 1
TBP-like 1
TBP-like 1
TBP-like 1
TBP-like 1
TBP-like 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a member of the TATA box-binding protein family. TATA box-binding proteins play a critical role in transcription by RNA polymerase II as components of the transcription factor IID (TFIID) complex. The encoded protein does not bind to the TATA box and initiates transcription from TATA-less promoters. This gene plays a critical role in spermatogenesis, and single nucleotide polymorphisms in this gene may be associated with male infertility. Alternatively spliced transcript variants have been observed for this gene, and a pseudogene of this gene is located on the long arm of chromosome 3. [provided by RefSeq, Nov 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 6:133952170-133990432 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q23.2 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 24 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Basal transcription factors pathway
Huntington's disease pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001253676 NM_004865 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS5168 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||