Homo sapiens Gene: PDCD2 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-99325.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | PDCD2 | ||||||||||||||||||
Gene Name | programmed cell death 2 | ||||||||||||||||||
Synonyms | RP8; ZMYND7 | ||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000071994 | ||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
programmed cell death 2
programmed cell death 2
programmed cell death 2
programmed cell death 2
programmed cell death 2
programmed cell death 2
programmed cell death 2
programmed cell death 2
programmed cell death 2
programmed cell death 2
programmed cell death 2
programmed cell death 2
programmed cell death 2
programmed cell death 2
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Protein Structure | |||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a nuclear protein expressed in a variety of tissues. Expression of this gene has been shown to be repressed by B-cell CLL/lymphoma 6 (BCL6), a transcriptional repressor required for lymph node germinal center development, suggesting that BCL6 regulates apoptosis by its effects on this protein. Alternative splicing results in multiple transcript variants and pseudogenes have been identified on chromosomes 9 and 12. [provided by RefSeq, Dec 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 6:170575295-170584692 | ||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||
Band | q27 | ||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 13 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||
NETPATH |
TNFalpha pathway
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REACTOME | |||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
UniGene | Hs.367900 Hs.741995 Hs.743857 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001199461 NM_001199462 NM_001199463 NM_001199464 NM_002598 NM_144781 XM_006715498 | ||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||
CCDS | CCDS47521 CCDS5316 CCDS56460 CCDS56461 CCDS56462 CCDS75557 | ||||||||||||||||||
HPRD | 02922 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||