Homo sapiens Protein: NOTCH2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-101548.5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | NOTCH2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | notch 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | AGS2; HJCYS; hN2; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000256646 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-101546 (NOTCH2) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Functions as a receptor for membrane-bound ligands Jagged1, Jagged2 and Delta1 to regulate cell-fate determination. Upon ligand activation through the released notch intracellular domain (NICD) it forms a transcriptional activator complex with RBPJ/RBPSUH and activates genes of the enhancer of split locus. Affects the implementation of differentiation, proliferation and apoptotic programs (By similarity). Involved in bone remodeling and homeostasis. In collaboration with RELA/p65 enhances NFATc1 promoter activity and positively regulates RANKL-induced osteoclast differentiation. {ECO:0000250, ECO:0000269PubMed:21378985, ECO:0000269PubMed:21378989}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cell membrane; Single-pass type I membrane protein.Notch 2 intracellular domain: Nucleus. Note=Following proteolytical processing NICD is translocated to the nucleus. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | Alagille syndrome 2 (ALGS2) [MIM:610205]: A form of Alagille syndrome, an autosomal dominant multisystem disorder. It is clinically defined by hepatic bile duct paucity and cholestasis in association with cardiac, skeletal, and ophthalmologic manifestations. There are characteristic facial features and less frequent clinical involvement of the renal and vascular systems. {ECO:0000269PubMed:16773578}. Note=The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry.Hajdu-Cheney syndrome (HJCYS) [MIM:102500]: A rare skeletal disorder characterized by the association of facial anomalies, acro-osteolysis, general osteoporosis, insufficient ossification of the skull, and periodontal disease (premature loss of permanent teeth). Other features include cleft palate, congenital heart defects, polycystic kidneys, orthopedic problems and anomalies of the genitalia, intestines and eyes. {ECO:0000269PubMed:21378985, ECO:0000269PubMed:21378989}. Note=The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry. NOTCH2 mutations associated with Hajdu- Cheney syndrome cluster to the last coding exon of the gene. This suggests that the mutant mRNA products may escape nonsense- mediated decay and the resulting truncated NOTCH2 proteins act in a gain-of-function manner. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Expressed in the brain, heart, kidney, lung, skeletal muscle and liver. Ubiquitously expressed in the embryo. {ECO:0000269PubMed:21378985}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 36 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 7 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000742
Epidermal growth factor-like domain IPR000800 Notch domain IPR001881 EGF-like calcium-binding domain IPR002110 Ankyrin repeat IPR008297 Notch IPR010660 Notch, NOD domain IPR011656 Notch, NODP domain IPR013111 EGF-like domain, extracellular IPR020683 Ankyrin repeat-containing domain IPR022336 Neurogenic locus Notch 2 IPR024600 Domain of unknown function DUF3454, notch |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PFAM |
PF00008
PF00066 PF07645 PF00023 PF13606 PF06816 PF07684 PF07974 PF11929 PF12796 PF11936 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PRINTS |
PR01452
PR01415 PR01985 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF |
PIRSF002279
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00181
SM00004 SM00179 SM00248 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q04721 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q04721 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q9UFD5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 4853 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.601926 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_077719 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:7882 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 600275 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS908 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 02606 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AF308601 AF315356 AL133036 AL359752 AL512503 AL596222 U50549 U77493 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA36377 AAB17664 AAB19224 AAG37073 CAB61366 CAH70182 CAH72483 CAI18974 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||