Version 5.4
| Homo sapiens Protein: SEMA6C | |||||||||||||||||||
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| Summary | |||||||||||||||||||
| InnateDB Protein | IDBP-102293.6 | ||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
| Gene Symbol | SEMA6C | ||||||||||||||||||
| Protein Name | sema domain, transmembrane domain (TM), and cytoplasmic domain, (semaphorin) 6C | ||||||||||||||||||
| Synonyms | m-SemaY; m-SemaY2; SEMAY; | ||||||||||||||||||
| Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
| Ensembl Protein | ENSP00000357910 | ||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-102291 (SEMA6C) | ||||||||||||||||||
| Protein Structure |
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| UniProt Annotation | |||||||||||||||||||
| Function | Shows growth cone collapsing activity on dorsal root ganglion (DRG) neurons in vitro. May be a stop signal for the DRG neurons in their target areas, and possibly also for other neurons. May also be involved in the maintenance and remodeling of neuronal connections. {ECO:0000269PubMed:12110693}. | ||||||||||||||||||
| Subcellular Localization | Cell membrane; Single-pass type I membrane protein. | ||||||||||||||||||
| Disease Associations | |||||||||||||||||||
| Tissue Specificity | In adult tissues, expressed only in skeletal muscle. {ECO:0000269PubMed:12110693}. | ||||||||||||||||||
| Comments | |||||||||||||||||||
| Interactions | |||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
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| Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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| Biological Process |
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| Cellular Component |
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| Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||
| PDB ID | |||||||||||||||||||
| InterPro |
IPR001627
Sema domain IPR002165 Plexin IPR016201 Plexin-like fold |
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| PFAM |
PF01403
PF01437 |
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| PRINTS | |||||||||||||||||||
| PIRSF | |||||||||||||||||||
| SMART |
SM00630
SM00423 |
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| TIGRFAMs | |||||||||||||||||||
| Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||
| Modification | |||||||||||||||||||
| Cross-References | |||||||||||||||||||
| SwissProt | Q9H3T2 | ||||||||||||||||||
| PhosphoSite | PhosphoSite-Q9H3T2 | ||||||||||||||||||
| TrEMBL | Q9UFI1 | ||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
| Entrez Gene | 10500 | ||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.713961 | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_112175 | ||||||||||||||||||
| HUGO | HGNC:10740 | ||||||||||||||||||
| OMIM | 609294 | ||||||||||||||||||
| CCDS | CCDS984 | ||||||||||||||||||
| HPRD | 10220 | ||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||
| EMBL | AB022434 AB058772 AF055020 AF339152 AF339153 AF339154 AL122064 AL592424 CH471121 | ||||||||||||||||||
| GenPept | AAC09365 AAL72098 AAL72099 AAL72100 BAB20670 BAB47498 CAB59243 CAI16376 CAI16377 CAI16378 EAW53470 EAW53472 | ||||||||||||||||||