Mus musculus Protein: Nid1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-130602.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Nid1 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | nidogen 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | A630025O17; entactin; entactin-1; Nid; nidogen-1; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000005532 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-130600 (Nid1) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Sulfated glycoprotein widely distributed in basement membranes and tightly associated with laminin. Also binds to collagen IV and perlecan. It probably has a role in cell- extracellular matrix interactions. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Secreted, extracellular space, extracellular matrix, basement membrane. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 22 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 10 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:97342 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000033
LDLR class B repeat IPR000716 Thyroglobulin type-1 IPR000742 Epidermal growth factor-like domain IPR001881 EGF-like calcium-binding domain IPR003886 Nidogen, extracellular domain IPR006605 G2 nidogen/fibulin G2F IPR009017 Green fluorescent protein |
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PFAM |
PF00058
PF00086 PF00008 PF07645 PF06119 PF07474 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00135
SM00211 SM00181 SM00179 SM00539 SM00682 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | P10493 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P10493 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q99N24 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 18073 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.4691 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_035047 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | 1NPE | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Nid1 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS26244 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AF228347 AH003206 AK041633 AK084876 AK144878 AK166779 BC131669 CT030166 X14194 X14480 X83093 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA77652 AAI31670 AAK14939 BAC31014 BAC39300 BAE26114 BAE39014 CAA32408 CAA32642 CAA58148 | ||||||||||||||||||||||