Mus musculus Protein: Ciita | |||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-132347.6 | ||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Ciita | ||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | class II transactivator | ||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | C2ta; EG669998; Gm9475; | ||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000023147 | ||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-132343 (Ciita) | ||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||
Function | Essential for transcriptional activity of the HLA class II promoter; activation is via the proximal promoter. No DNA binding of in vitro translated CIITA was detected. May act in a coactivator-like fashion through protein-protein interactions by contacting factors binding to the proximal MHC class II promoter, to elements of the transcription machinery, or both. Alternatively it may activate HLA class II transcription by modifying proteins that bind to the MHC class II promoter. Also mediates enhanced MHC class I transcription, the promoter element requirements for CIITA-mediated transcription are distinct from those of constitutive MHC class I transcription, and CIITA can functionally replace TAF1 at these genes. Exhibits intrinsic GTP-stimulated acetyltransferase activity. Exhibits serine/threonine protein kinase activity: phosphorylates the TFIID component TAF7, the RAP74 subunit of the general transcription factor TFIIF, histone H2B at 'Ser-37' and other histones (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus. Nucleus, PML body {ECO:0000250}. Note=Recruited to PML body by PML. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Isoform 1 is expressed at very high levels in dendritic cells, at very low levels in spleen and thymus and is not detected in other tissues. Isoform 2 is detected at high levels in spleen and tonsil as well as in a number of B-lymphocyte cell lines, and at very low levels in dendritic cells. {ECO:0000269PubMed:9184229}. | ||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 26 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 47 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:108445 | ||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001611
Leucine-rich repeat IPR003590 Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype IPR007111 NACHT nucleoside triphosphatase IPR008095 MHC class II transactivator IPR027417 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase |
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PFAM |
PF00560
PF13504 PF13855 |
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PRINTS |
PR01719
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00368
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P79621 | ||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite- | ||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q3U5G4 | ||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 12265 | ||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.249560 | ||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_031601 | ||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Ciita | ||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS27950 | ||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AF000006 AF000007 AF042158 AF042159 AF100709 AF100710 AK153609 CH466521 U46562 U60653 | ||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAB05004 AAB48859 AAB92364 AAB92365 AAC34366 AAC34367 AAF06838 AAF06839 BAE32115 EDK97316 | ||||||||||||||||||||||||||