Mus musculus Protein: Kdm6a | |||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-133898.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Kdm6a | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | lysine (K)-specific demethylase 6A | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Utx; | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000061539 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-133896 (Kdm6a) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Histone demethylase that specifically demethylates 'Lys- 27' of histone H3, thereby playing a central role in histone code. Demethylates trimethylated and dimethylated but not monomethylated H3 'Lys-27'. Plays a central role in regulation of posterior development, by regulating HOX gene expression. Demethylation of 'Lys-27' of histone H3 is concomitant with methylation of 'Lys-4' of histone H3, and regulates the recruitment of the PRC1 complex and monoubiquitination of histone H2A (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000305}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Expressed in brain, heart and spleen. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 5 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 22 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1095419 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001440
Tetratricopeptide TPR1 IPR003347 JmjC domain IPR013026 Tetratricopeptide repeat-containing domain IPR019734 Tetratricopeptide repeat |
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PFAM |
PF00515
PF02373 PF08007 PF13174 PF13176 PF13181 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00558
SM00028 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | O70546 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-O70546 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 22289 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.471789 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_033509 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Kdm6a | ||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS30037 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AJ002730 AL732451 AL773547 BC053433 BC075703 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH53433 AAH75703 CAA05692 CAM18408 CAM27157 | ||||||||||||||||||||||||||||||||