Mus musculus Protein: Sema3e | |||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-135742.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Sema3e | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3E | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 6430702L12; AA408817; mKIAA0331; Semah; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000073612 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-135740 (Sema3e) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Plays an important role in signaling via the cell surface receptor PLXND1. Mediates reorganization of the actin cytoskeleton, leading to the retraction of cell projections. Promotes focal adhesion disassembly and inhibits adhesion of endothelial cells to the extracellular matrix. Regulates angiogenesis, both during embryogenesis and after birth. Can down- regulate sprouting angiogenesis. Required for normal vascular patterning during embryogenesis. Plays an important role in ensuring the specificity of synapse formation. {ECO:0000269PubMed:15550623, ECO:0000269PubMed:19421194, ECO:0000269PubMed:20385769, ECO:0000269PubMed:22179111}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Secreted. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Detected in neurons in the thalamus. Detected in embryonic vasculature. Developing lungs, developing skeletal elements and ventral horns of the developing neural tube. Correlates positively with tumor progression. {ECO:0000269PubMed:15550623, ECO:0000269PubMed:22179111}. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||
Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1340034 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001627
Sema domain IPR003599 Immunoglobulin subtype IPR007110 Immunoglobulin-like domain IPR013106 Immunoglobulin V-set domain IPR013151 Immunoglobulin IPR016201 Plexin-like fold |
||||||||||||||||||||||
PFAM |
PF01403
PF07686 PF00047 |
||||||||||||||||||||||
PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00630
SM00409 SM00423 |
||||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | P70275 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite- | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q8K4M3 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 20349 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.415788 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_035478 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Sema3e | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS19093 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AF034744 AF164785 AK129116 BC057956 CH466635 Z80941 Z93947 Z93948 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAD01996 AAH57956 AAM96213 BAC97926 CAB02590 CAB07987 CAB07988 EDL38710 | ||||||||||||||||||||||