Mus musculus Gene: Sema3e | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-135740.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Sema3e | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3E | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 6430702L12; AA408817; mKIAA0331; Semah | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000063531 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3E
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000170381:
Semaphorins are a large family of conserved secreted and membrane associated proteins which possess a semaphorin (Sema) domain and a PSI domain (found in plexins, semaphorins and integrins) in the N-terminal extracellular portion. Based on sequence and structural similarities, semaphorins are put into eight classes: invertebrates contain classes 1 and 2, viruses have class V, and vertebrates contain classes 3-7. Semaphorins serve as axon guidance ligands via multimeric receptor complexes, some (if not all) containing plexin proteins. This gene encodes a class 4 semaphorin. This gene encodes a class 3 semaphorin. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene.[provided by RefSeq, May 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 5:14025276-14256689 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | A1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Axon guidance pathway
Developmental Biology pathway
Semaphorin interactions pathway
Other semaphorin interactions pathway
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KEGG |
Axon guidance pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Other semaphorin interactions pathway
Developmental Biology pathway
Semaphorin interactions pathway
Axon guidance pathway
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KEGG |
Axon guidance pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Plexin-D1 Signaling
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.134093 Mm.415788 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_011348 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS19093 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||